O Colégio Portinari oferece o Ensino Fundamental I do 1º ao 5º Ano, e tem como objetivo o desenvolvimento integral da criança em seus aspectos físico, psicológico, intelectual e social, complementando a ação da família e da comunidade.
Nesta fase a aprimoração do conhecimento pode ser comparado ao ato de tecer, que é único e cheio de singularidade.
A não padronização do comportamento e ações de cada aluno representa suas interações com o mundo sócio cultural e natural e estas vão norteando a aprendizagem no Ensino Fundamental I.
O olhar sensível para as produções infantis permitirá conhecer os interesses das crianças, os conhecimentos que estão sendo apropriados por elas, assim como os elementos culturais do grupo social em que estão imersas.
O encanto da leitura , da escrita, da lógica matemática  e outras áreas do conhecimento formam a base para as demais etapas de estudos.

O Colégio Portinari oferece o Ensino Fundamental II do 6º ao 9º Ano, e tem como objetivo o desenvolvimento integral da criança e do adolescente em seus aspectos físico, psicológico, intelectual e social, complementando a ação da família e da comunidade.
Os objetivos do Ensino Fundamental são:
1. O desenvolvimento da capacidade de aprender, tendo como meios básicos o pleno domínio da leitura, da escrita e do cálculo.
2. A compreensão do ambiente natural e social, do sistema político, da tecnologia, das artes e dos valores em que se fundamenta a sociedade.
3. O desenvolvimento da capacidade de aprendizagem, tendo em vista a aquisição de conhecimentos e habilidades e a formação de atitudes e valores.
4. O fortalecimento dos vínculos de família, dos laços de solidariedade humana e de tolerância recíproca em que se assenta a vida social.
5. O domínio de competências e habilidades que levem à consciência da cidadania e facilitem a melhor inserção do educando no ambiente social.

O Colégio Portinari a partir de 2012 incluiu em suas atividades o curso de Ensino Médio, tendo como objetivos:
I. a consolidação e o aprofundamento dos conhecimentos adquiridos no ensino fundamental, possibilitando o prosseguimento de estudos;
II. a preparação básica para o trabalho e a cidadania do educando, para continuar aprendendo, de modo a ser capaz de se adaptar com flexibilidade a novas condições de ocupação ou aperfeiçoamento posteriores;
III. o aprimoramento do educando como pessoa humana, incluindo a formação ética e o desenvolvimento da autonomia intelectual e do pensamento crítico;
IV. a compreensão dos fundamentos científico-tecnológicos dos processos produtivos, relacionando a teoria com a prática, no ensino de cada disciplina.
V. Hoje sua grade currícular já atende as novas determinações da BNCC , ofertando a formação básica e a parte eletiva, além de manter os estudos de Educação física , Filosofia e Sociologia no Ensino Médio.